A observação detalhada e de longo período de GEEs é um elemento chave na quantificação das emissões, contribui para a compreensão do ciclo biogeoquímico de carbono e para a previsão do conhecimento do impacto das alterações climáticas.

O ICOS-PT (Sistema Integrado de Observação de Carbono) é a rede portuguesa de investigação e monitorização do carbono e de outros gases com efeito estufa (GEE) em ecossistemas terrestres, coordenada pelo CEF, que segue metodologias em conformidade com a Infraestrutura Europeia ICOS.

A observação detalhada e de longo período de GEEs é um elemento chave na quantificação das emissões, contribui para a compreensão do ciclo biogeoquímico de carbono e para a previsão do conhecimento do impacto das alterações climáticas em diversos ecossistemas: áreas naturais protegidas, florestas de produção, culturas agrícolas ou áreas urbanas.

Os dados fornecidos pelo ICOS-PT complementam as observações fornecidas por outros domínios do PORBIOTA, fornecendo informações de alta qualidade e no longo prazo sobre as condições ambientais que subjazem às alterações observadas em ecologia.

Atualmente existem quatro torres de medição de fluxos de gases com efeito estufa em Portugal. As torres de medição de gases com efeito de estufa estão localizadas no Porto, Verdemilho, Coruche e Companhia das Lezirias. Todas as estações de pesquisa medem as trocas de CO2 e H2O entre a biosfera e a atmosfera com alta precisão e detalhes temporais, juntamente com variáveis ​​micro-meteorológicas. 

   Torre de Coruche; está inserida num montado de sobro com baixo impacto de gestão. O principal objectivo da gestão florestal é a produção de cortiça mas também são considerados outros serviços ecossistémicos  (ex .: biodiversidade e sequestro de carbono).

   Torre situada na Companhia das Lezirias (CdL); é também um montado de sobro mas com menor densidade de árvores. Ambas as estações de pesquisa (Coruche e CdL) estão posicionadas ao longo de um transecto Este-Oeste, sendo a torre de  CdL influenciado pela próxima brisa do oceano. O CdL está sendo criado e deve estar operacional em junho de 2021.

  Estação de monitorização do Porto; está localizada a cerca de 2 km a norte do centro antigo da cidade e 5 km a leste da fronteira marítima, a uma altitude de 132 m acima do nível do mar. A torre é equipada com sensores medições dos fluxos de CO2 e H2O e foi colocada cerca de 32 m acima da superfície do solo. Possui também sensores para balanço de energia, temperatura e umidade relativa.

  Estação de Verdemilho; localiza-se numa zona suburbana do concelho de Aveiro, a cerca de 8 km a Este do Oceano Atlântico. A torre é equipada com sensores para medições de fluxos de CO2 e H2O, balanço energético, temperatura e umidade relativa. Neste local também são feitas medições contínuas da temperatura do solo (2, 10 e 20 cm de profundidade), umidade do solo (2, 15 e 30 cm de profundidade) e fluxo de calor no solo (8 cm de profundidade).